(1)包含性

傳統手書籤名是含在文件中的,是文件的一部分,在簽一個支票的時候,簽名就在支票上,而不是一個單獨的文件。但當數字簽名一個文件時,把簽名當作一個單獨的文件來發送。發送者發送兩個文件:信息與簽名。接收者也接收兩個文件，並且要證實簽名是屬於假定發送者的。如果簽名被證實了,就保存信息,否則就拒絕。

(2)驗證方法

兩種簽名的第二種區別就是驗證簽名的方法不同。對傳統簽名來說,接收者接收一個文件後,就要對比文件上的簽名與檔案上的簽名。如果相同,文件就是可信的。接收者需要有一個檔案上簽名的副本來對比。對於數字簽名來說,接收者接收的是信息和簽名。所有地方均不會有此簽名的副本。接收者必須使用一種驗證技術來驗證信息和簽名,以證實其真實性。

(3)關係

對於傳統簽名來說,簽名和文件通常是一對多的關係。某人可用一個簽名去簽多個文件。對數字簽名而言,簽名和信息是一對一的關係。每一個信息擁有它自己的簽名,一個信息的簽名不能用在另一個信息上。如果Bob相繼接收兩個來自Alice的信息，那他就不能用第一個信息的簽名來驗證第二個。每一個信息都需要一個新的簽名。

(4)二重性

兩種簽名的另一個區別是一種稱為二重性的性質。在傳統簽名中,已簽名文件的副本可以和檔案中的原始簽名相區別。在數字簽名中,除了時間因素(如時間戳)以外,在文件上沒有這種區別。例如,假定Alice發送一個文件,指示Bob向Tom付款。如果Tom攔截了這個信息和簽名,他就可以重放這一信息,以便再次從Bob那裏得到付款。